Anno 1404

Kampaň sa začína, keď je hráč vyslaný spravovať léno, ktoré mu udelil cisár na Západe. Cisár sa necíti dobre a lord Richard Northburgh, cisárov bratranec a pokladník, stavia veľkolepú katedrálu, aby sa modlil za cisárovo zdravie. Medzitým kardinál Lucius pripravuje krížovú výpravu proti Saracénom v Oriente, v ktorej mu pomáha Guy Forcas. V prvých kapitolách kampane sa hráč oboznámi so základmi hry a ekonomiky tým, že pomáha Northburgovi a Forcasovi so zásobovacími a stavebnými úlohami, ako aj spoznáva niektoré ďalšie hlavné postavy. Keď križiacke lode opúšťajú prístav, Northburgh začína odhaľovať stopy záhadného sprisahania. Spolu s hráčom cestuje do Orientu a spriatelí sa s veľkovezírom sultána Al Zahírom, ktorý hráčovi pomôže poraziť skupinu korzárov a rozbiť plán obchodovania s deťmi. Zápletka sa zahusťuje, keď ďalšie stopy odhalia, že hlavná postava je zapletená do zlovestného sprisahania s cieľom zvrhnúť samotného cisára. Pretože sa príliš priblíži k pravde, lord Northburgh je zajatý a hráč má za úlohu rozlúštiť záhadu. Počas niekoľkých nasledujúcich kapitol musí hráč získať nových spojencov, presvedčiť vodcov križiackej výpravy, že sú manipulovaní pod falošnou zámienkou, a prežiť hrozivé okolnosti, aby porazil zloduchov a navrátil cisára na jeho právoplatné miesto. Kampaň je rozdelená do ôsmich kapitol a každú kapitolu možno hrať na 3 rôzne obtiažnosti: ľahkú, strednú a ťažkú. Okrem príbehových prvkov slúži kampaň ako tutoriál, ktorý hráča pripraví na náročnejšie scenáre a režimy súvislej hry. Všetky hlavné postavy, s ktorými sa stretnete v kampani, sa vyskytujú aj v režime scenárov a možno ich vybrať ako počítačových protivníkov v kontinuálnych hrách, hoci činy postáv počas kampane nesúvisia s ich činmi v týchto režimoch okrem toho, že majú podobné osobnosti. Lord Northburgh a Al Zahir pôsobia v ostatných režimoch ako mentori a obchodní partneri podobne ako v kampani.